Может ли знание того, откуда произошли ваши предки, быть ключом к лучшему лечению рака? Может быть, но куда этот ключ подойдет? Как мы можем проследить наследственные корни рака до современных решений? По мнению профессора-исследователя Лаборатории Колд-Спринг-Харбор (CSHL) Александра Красница, ответы могут лежать глубоко в обширных базах данных и больничных архивах, содержащих сотни тысяч образцов опухолей.
Красниц и научный сотрудник CSHL Паскаль Белло работают над выявлением генеалогической связи между раком и расой или этнической принадлежностью. Они разработали новое программное обеспечение , которое точно определяет континентальное происхождение по ДНК и РНК опухоли. Их последнее исследование опубликовано в журнале Cancer Research , и их работа может помочь клиницистам разработать новые стратегии раннего выявления рака и персонализированного лечения.
«Почему люди разных рас и национальностей заболевают разными видами рака с разной скоростью? У них разные привычки, условия жизни, воздействия — все виды социальных и экологических факторов . Но может быть и генетический компонент».
Команда Красница обучила свои программные инструменты, используя гибридные профили ДНК. Они создали эти профили из раковых и неродственных свободных от рака геномов известного происхождения. Затем они проверили работу программного обеспечения на образцах рака поджелудочной железы, яичников, молочной железы и крови у пациентов с известным происхождением. Команда обнаружила, что программное обеспечение сопоставило их гибридные профили с континентальным населением с точностью более 95%.
«У нас есть хорошая модель, на которую можно опираться, — говорит Красниц. «Но очень немногие люди происходят от одного предка. Мы все в какой-то степени смешаны. Поэтому сейчас мы работаем над тем, чтобы заглянуть глубже, протестировать образцы опухолей неизвестного происхождения, выявить смешение предков и добиться большей региональной специфичности». Насколько конкретно? А пока представьте себе Западную Африку, а не Восточную Африку.
Красниц и Белло недавно присоединились к исследованию колоректального рака в сотрудничестве с Northwell Health и SUNY Downstate Medical Center. Исследование позволяет им изучить, как колоректальный рак по- разному мутирует гены в зависимости от конкретной расы или этнической принадлежности. Они надеются еще больше усовершенствовать свое программное обеспечение, чтобы сделать вывод о происхождении не только целых геномов, но и каждой отдельной последовательности в них.
«Если мы сможем идентифицировать более локализованные предки, которые восприимчивы к различным видам рака или другим агрессивным заболеваниям, это может помочь нам определить конкретную часть генома, ответственную за это, и нацелить ее на лечение», — говорит Белло.
Прямо сейчас простой мазок ДНК может сказать вам, откуда вы родом и какие болезни вы можете унаследовать. В будущем это может дать вам возможность победить и их.
