Найден лучший метод измерения генов

Прочитано: 43 раз(а)
1 Звезда2 Звезды3 Звезды4 Звезды5 Звезд (Оценок пока нет)
Loading ... Loading ...


Ученые LMU разработали метод более эффективного измерения активности генов и, таким образом, лучшего понимания биологических процессов.

Все клетки имеют одни и те же гены, но для их различных функций важно, какие гены активны, когда, где и в какой степени. Активные гены копируются в клетке в молекулу информационной РНК (мРНК), которая действует как руководство по конструированию соответствующего белка. Следовательно, какие из примерно 20 000 генов человеческой клетки в каком количестве присутствуют в виде мРНК, очень информативно с точки зрения понимания биологических процессов.


В течение нескольких лет стало возможным получить хорошее измерение всего спектра мРНК — транскриптома — с помощью высокопроизводительного секвенирования, которое включает секвенирование копий мРНК образца и их подсчет для каждого гена. Эта «РНК-последовательность» стала одним из ключевых инструментов молекулярной биологии. «Эффективная секвенирование РНК определяет, сколько образцов я могу проанализировать и, следовательно, сколько биологической информации я могу получить с заданным бюджетом», — говорит биолог LMU Вольфганг Энард, который вместе со своей командой разработал, пожалуй, самый эффективный метод секвенирования РНК в настоящее время. доступный.

Исследователи назвали свой метод prime-seq и уже успешно применили его более чем в 30 различных публикациях внутри и за пределами LMU. В своей последней статье в журнале Genome Biology они показали, что Prime-seq измеряет транскриптом так же хорошо, как и другие протоколы RNA-seq, будучи в 50 раз более экономичным.

Метод может быть реализован в любой лаборатории молекулярной биологии без необходимости использования дорогостоящего оборудования. Его эффективность основана прежде всего на интеграции штрих-кодов ДНК и прямом извлечении мРНК из клеток. «Надежные, проверенные и экономичные методы становятся все более важными в растущем исследовательском ландшафте. И мы надеемся, что наш метод также внесет вклад в большую открытость и воспроизводимость в науке», — говорит Лукас Ванге, один из ведущих авторов исследования.

Найден лучший метод измерения генов



Новости партнеров