Исследователи из Университета Цукуба расшифровали ядерный геном Amorphochlora amoebiformis, одноклеточной морской водоросли, принадлежащей к группе хлорарахниофитов.

Работа опубликована в журнале DNA Research.

Появление технологий секвенирования нового поколения ускорило анализ геномов в различных эукариотических линиях. В частности, секвенирование длинных прочтений облегчает сборку больших, сложных геномов, содержащих высокую долю повторяющихся элементов.

В этом исследовании ученые использовали секвенирование длинных прочтений для расшифровки ядерного генома Amorphochlora amoebiformis, выявив приблизительную длину в 214 миллионов пар оснований, кодирующих около 17 500 белков, при этом интроны составляют 74% геномной последовательности. По сравнению с другими эукариотическими геномами, доля интронов здесь чрезвычайно высока.

Примечательно, что интроны (некодирующие последовательности, обычно удаляемые в результате сплайсинга) составляют приблизительно три четверти генома, что делает его самым богатым интронами эукариотическим геномом из всех известных на сегодняшний день.

Поскольку у близкородственного вида хлорарахниофитов, Bigelowiella natans, содержание интронов составляет около 30%, можно предположить, что значительное увеличение количества интронов, наблюдаемое в ядерном геноме A. amoebiformis, произошло независимо в процессе его эволюции.

Хотя причина этого увеличения остается неизвестной, данное исследование дает важные сведения об эволюционной динамике и потенциальной функциональной роли интронов в эукариотических геномах.