Согласно недавно опубликованным исследованиям, исследователям в области медицины и биологических наук будет полезен самый полный атлас генетических данных о рыбках данио.

Атлас поможет исследователям лучше изучить различные виды рака (например, рак кожи), болезни сердца и нейродегенерацию. Это может помочь большему количеству исследователей заменить модели млекопитающих в своих исследованиях.

Консорциум DANIO-CODE, общенациональная команда из 27 лабораторий, работал вместе над каталогизацией опубликованных наборов данных с открытым доступом, компенсированных новыми данными. В результате было получено 140 000 участков ДНК, участвующих в регуляции экспрессии генов у рыбок данио.

Исследование, посвященное рыбкам данио, второй наиболее часто используемой животной модели для исследований в области медицины и наук о жизни , основано на 1802 образцах с миллионами точек данных в каждом и дает самую широкую картину областей ДНК-кандидатов для трансгенной селекции и генетических исследований развития и болезней.

В статье, опубликованной сегодня в журнале Nature Genetics , подробно описаны элементы ДНК, участвующие в нескольких эмбриональных стадиях развития, а также улучшено понимание генетической эквивалентности между рыбками данио и мышами.

Ференц Мюллер, профессор генетики развития Бирмингемского университета, возглавлявший консорциум этого исследования, сказал:

«Каталогизация генетической информации рыбок данио — это значительный прорыв, который может лежать в основе некоторых из самых захватывающих разработок в области медицины и наук о жизни на долгие годы.

«Профессор Борис Ленхард из Имперского колледжа Лондона и профессор Карстен Дауб из Каролинского института сыграли важную роль в координации более 50 исследователей по всему миру. Получившийся в результате атлас/карта является свидетельством того, как восходящая инициатива трансграничного сотрудничества может принести пользу Каталог, созданный консорциумом DANIO-CODE, находится в открытом доступе, чтобы исследователи могли использовать генетическую информацию для своих будущих исследований.

«Рыбки данио — невероятно полезная модель для исследователей. Они — идеальные кандидаты для изучения различных заболеваний и расстройств, потому что они растут как эмбрионы и обладают необычными регенеративными свойствами. Эти свойства уже дали исследователям представление о состоянии человека».

«Теперь, с нашим новым каталогом, мы приближаемся на один шаг к тому, чтобы иметь полностью реализованную карту, с которой можно наложить геном человека. Этот вид деятельности позволит исследователям во всем мире в темпе искать новые методы лечения, лекарства и лучшие понимание болезней человека и животных».

Карстен Дауб, доцент и руководитель группы Департамента биологических наук и питания (KI) и Лаборатории науки для жизни Каролинского института, руководивший интеграцией данных, сказал:

«Это обширное исследование объединяет все отдельные наборы данных в одну структуру, позволяющую исследователям по всему миру решать вопросы, которые не могут быть решены в рамках отдельных исследований».