Русские ученые создали программу для скорого анализа совокупности генов

Прочитано: 431 раз(а)


По утверждению медперсонала, результаты их проектов размещены в журнале под названием Bioinformatics.

Как докладывают авторы работы, не менее основательно изучить результаты исследований можно в печатном издании Bioinformatics, как в статье утверждают ученые, каждый человек владеет некоторой определенной последовательностью наследственных веществ, в соответствии нее и развивается человеческий организм. Однако существует и еще одна полседовательность генов, метагеном, представляющая собой совокупность ДНК микробов, обитающих в одной среде: бактерий, грибов, вирусов. Такой анализ даст возможность лечить человека «персонально», а кроме этого несомненно поможет изучить ранее неизвестные науке болезнетворные организмы. Поэтому изучение микробиоты, другими словами совокупности микробов, населяющих разные департаменты организма человека, занимает особое место в метагеномных исследованиях.

MetaFast (так называется программа, разработанная учеными) быстро анализирует огромное количество метагеномов.

«При исследовании микрофлоры кишечника пациентов могут быть выявлены микроорганизмы, ассоциируемые с каким-либо заболеванием, например, с диабетом либо предрасположенностью к нему. А это уже предпосылки для использования персонализированной медицины и создания новых лекарств», — приводит pr-служба слова основного разработчика алгоритма, сотрудника Международной лаборатории «Компьютерные технологии» Университета ИТМО Владимира Ульянцева. Разработали его профессионалы из МФТИ, Университета ИТМО и ФНКЦ физико-химической медицины. В таком случае не маловажно применение персонализированной медицины, создание безусловно новых фармацевтических средств.

Разработка может использоваться не только лишь для выявления патогенных микробов. К примеру, сравнение метагеномов самобытных народов в замкнутых популяциях с жителями городов может посодействовать выделить бактериальные штаммы, полезные для людей, однако утерянные в процессе урбанизации.

Как отмечают ученые, на данный момент в мире накоплены большие объемы знаний о разнообразных метагеномах. Благодаря тому, что стоимость извлечения ДНК уменьшается, а чувствительность оборудования возрастает, объемы этих данных продолжают расти экспоненциально. Причина — в существующих технологиях. Ученые могут частично собрать метагеном, однако на сборку его уходит затяжное время. Тут же находятся вирусы, грибы и бактерии.

Новая программа сочетает достоинства обоих подходов при высокой скорости обработки информации.

программу для скорого анализа совокупности генов



Новости партнеров